سیستم WCS وظیفه زمانبندی بین سیستم و تجهیزات را بر عهده دارد و دستورات صادر شده توسط سیستم WMS را برای عملیات هماهنگ به هر یک از تجهیزات ارسال می کند. ارتباط مداوم بین تجهیزات و سیستم WCS وجود دارد. هنگامی که تجهیزات کار را کامل می کند، سیستم WCS به طور خودکار داده ها را با سیستم WMS ارسال می کند.